Protein–RNA interactions for Protein: D3Z236

Gm3676, Predicted gene 3676, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3676D3Z236 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3676D3Z236 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms