Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
4930467E23RikD3Z1P8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.9 ms