Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc8D3YZV8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms