Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf217D3YYI7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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