Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kpna7C0LLJ0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms