Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cfap58B2RW38 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms