Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usf3B2RUQ2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usf3B2RUQ2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms