Protein–RNA interactions for Protein: B1AZQ8

Cldn34b1, Claudin 34B1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b1B1AZQ8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn34b1B1AZQ8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn34b1B1AZQ8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn34b1B1AZQ8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms