Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PtpruB1AUH1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtpruB1AUH1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtpruB1AUH1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtpruB1AUH1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtpruB1AUH1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtpruB1AUH1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtpruB1AUH1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtpruB1AUH1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtpruB1AUH1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtpruB1AUH1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtpruB1AUH1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtpruB1AUH1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtpruB1AUH1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtpruB1AUH1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtpruB1AUH1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtpruB1AUH1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtpruB1AUH1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtpruB1AUH1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtpruB1AUH1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtpruB1AUH1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtpruB1AUH1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtpruB1AUH1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtpruB1AUH1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtpruB1AUH1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtpruB1AUH1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtpruB1AUH1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PtpruB1AUH1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtpruB1AUH1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PtpruB1AUH1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
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