Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Skint5A7XUY5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Skint5A7XUY5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Skint5A7XUY5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Skint5A7XUY5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Skint5A7XUY5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Skint5A7XUY5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Skint5A7XUY5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Skint5A7XUY5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Skint5A7XUY5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Skint5A7XUY5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Skint5A7XUY5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Skint5A7XUY5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Skint5A7XUY5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Skint5A7XUY5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Skint5A7XUY5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Skint5A7XUY5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Skint5A7XUY5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Skint5A7XUY5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Skint5A7XUY5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Skint5A7XUY5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Skint5A7XUY5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Skint5A7XUY5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Skint5A7XUY5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms