Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc9bA3KGF9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms