Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp8b5A3FIN4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms