Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms