Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scn3aA2ASI5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms