Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rtf1A2AQ19 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms