Protein–RNA interactions for Protein: A2APT9

Klhdc7a, Kelch domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc7aA2APT9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhdc7aA2APT9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhdc7aA2APT9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhdc7aA2APT9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhdc7aA2APT9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhdc7aA2APT9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhdc7aA2APT9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhdc7aA2APT9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhdc7aA2APT9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhdc7aA2APT9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhdc7aA2APT9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhdc7aA2APT9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhdc7aA2APT9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhdc7aA2APT9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhdc7aA2APT9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhdc7aA2APT9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhdc7aA2APT9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhdc7aA2APT9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Klhdc7aA2APT9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhdc7aA2APT9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms