Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtcflA2APF3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms