Protein–RNA interactions for Protein: A2ALW2

Zkscan16, Zinc finger with KRAB and SCAN domains 16, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan16A2ALW2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zkscan16A2ALW2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zkscan16A2ALW2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zkscan16A2ALW2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zkscan16A2ALW2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zkscan16A2ALW2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zkscan16A2ALW2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zkscan16A2ALW2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zkscan16A2ALW2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zkscan16A2ALW2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zkscan16A2ALW2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zkscan16A2ALW2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zkscan16A2ALW2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zkscan16A2ALW2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zkscan16A2ALW2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zkscan16A2ALW2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zkscan16A2ALW2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zkscan16A2ALW2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zkscan16A2ALW2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zkscan16A2ALW2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zkscan16A2ALW2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zkscan16A2ALW2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zkscan16A2ALW2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zkscan16A2ALW2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zkscan16A2ALW2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zkscan16A2ALW2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zkscan16A2ALW2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zkscan16A2ALW2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zkscan16A2ALW2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zkscan16A2ALW2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms