Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VirmaA2AIV2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VirmaA2AIV2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VirmaA2AIV2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VirmaA2AIV2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VirmaA2AIV2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
VirmaA2AIV2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144 ms