Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pramel3A2AHA7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms