Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc163A2AGD7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc163A2AGD7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms