Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmpd4A2AFR3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms