Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem185aA2AF53 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem185aA2AF53 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem185aA2AF53 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem185aA2AF53 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem185aA2AF53 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem185aA2AF53 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms