Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyb561d1A2AE42 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms