Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calcoco2A2A6M5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms