Protein–RNA interactions for Protein: A2A3V1

Akap17b, A-kinase anchor protein 17B, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap17bA2A3V1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Akap17bA2A3V1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Akap17bA2A3V1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms