Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm6268A2A3U9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm6268A2A3U9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm6268A2A3U9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm6268A2A3U9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm6268A2A3U9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm6268A2A3U9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm6268A2A3U9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm6268A2A3U9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm6268A2A3U9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm6268A2A3U9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm6268A2A3U9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm6268A2A3U9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm6268A2A3U9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm6268A2A3U9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm6268A2A3U9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm6268A2A3U9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm6268A2A3U9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm6268A2A3U9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm6268A2A3U9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm6268A2A3U9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm6268A2A3U9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm6268A2A3U9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm6268A2A3U9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm6268A2A3U9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm6268A2A3U9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm6268A2A3U9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms