Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc112A0AUP1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms