Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSN8

A730046J19Rik, RIKEN cDNA A730046J19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A730046J19RikA0A1B0GSN8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms