Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms