Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A0U1RNP2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms