Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SUM8

Gm45140, Predicted gene 45140, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45140A0A0N4SUM8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm45140A0A0N4SUM8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm45140A0A0N4SUM8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm45140A0A0N4SUM8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm45140A0A0N4SUM8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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