Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVH6

1520401A03Rik, RIKEN cDNA 1520401A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms