Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTR2

0610012G03Rik, RIKEN cDNA 0610012G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610012G03RikA0A0J9YTR2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms