Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Trbv26A0A0B4J1P5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Trbv26A0A0B4J1P5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Trbv26A0A0B4J1P5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Trbv26A0A0B4J1P5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Trbv26A0A0B4J1P5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Trbv26A0A0B4J1P5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trbv26A0A0B4J1P5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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