Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXF1

Ighv3-4, Immunoglobulin heavy variable V3-4 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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