Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ19

Gm28171, Predicted gene 28171, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28171A0A087WQ19 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm28171A0A087WQ19 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28171A0A087WQ19 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms