Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP35

Gm28919, Predicted gene 28919, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28919A0A087WP35 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Gm28919A0A087WP35 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Gm28919A0A087WP35 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Gm28919A0A087WP35 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Gm28919A0A087WP35 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Gm28919A0A087WP35 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28919A0A087WP35 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28919A0A087WP35 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28919A0A087WP35 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28919A0A087WP35 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28919A0A087WP35 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Gm28919A0A087WP35 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm28919A0A087WP35 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28919A0A087WP35 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28919A0A087WP35 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28919A0A087WP35 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
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Gm28919A0A087WP35 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28919A0A087WP35 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28919A0A087WP35 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28919A0A087WP35 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28919A0A087WP35 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28919A0A087WP35 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28919A0A087WP35 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28919A0A087WP35 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28919A0A087WP35 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28919A0A087WP35 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28919A0A087WP35 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28919A0A087WP35 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28919A0A087WP35 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28919A0A087WP35 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28919A0A087WP35 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28919A0A087WP35 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28919A0A087WP35 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm28919A0A087WP35 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Gm28919A0A087WP35 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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