Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5W1

Ighv1-50, Immunoglobulin heavy variable 1-50 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-50A0A075B5W1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv1-50A0A075B5W1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv1-50A0A075B5W1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv1-50A0A075B5W1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv1-50A0A075B5W1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv1-50A0A075B5W1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv1-50A0A075B5W1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv1-50A0A075B5W1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv1-50A0A075B5W1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv1-50A0A075B5W1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv1-50A0A075B5W1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv1-50A0A075B5W1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv1-50A0A075B5W1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv1-50A0A075B5W1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv1-50A0A075B5W1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv1-50A0A075B5W1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv1-50A0A075B5W1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv1-50A0A075B5W1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv1-50A0A075B5W1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv1-50A0A075B5W1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv1-50A0A075B5W1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv1-50A0A075B5W1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv1-50A0A075B5W1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv1-50A0A075B5W1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv1-50A0A075B5W1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv1-50A0A075B5W1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv1-50A0A075B5W1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv1-50A0A075B5W1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.1 ms