Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ilf3Q9Z1X4 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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