Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms