Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolkQ9QUG2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolkQ9QUG2 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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