Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Nectin3Q9JLB9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Nectin3Q9JLB9 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Nectin3Q9JLB9 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Nectin3Q9JLB9 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Nectin3Q9JLB9 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Nectin3Q9JLB9 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Nectin3Q9JLB9 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms