Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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TrmuQ9DAT5 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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TrmuQ9DAT5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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TrmuQ9DAT5 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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TrmuQ9DAT5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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TrmuQ9DAT5 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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TrmuQ9DAT5 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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TrmuQ9DAT5 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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TrmuQ9DAT5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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TrmuQ9DAT5 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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TrmuQ9DAT5 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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TrmuQ9DAT5 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrmuQ9DAT5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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