Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Zbed3Q9D0L1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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Zbed3Q9D0L1 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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Zbed3Q9D0L1 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Zbed3Q9D0L1 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Zbed3Q9D0L1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Zbed3Q9D0L1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Zbed3Q9D0L1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Zbed3Q9D0L1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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