Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms