Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Sgo1Q9CXH7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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