Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms