Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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