Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms